Epiontis ID 免疫モニタリング
- 新鮮なサンプルは不要。凍結全血や凍結組織、FFPE標本での実施が可能
- 微量検体で定量ができます。例：血液300μLより16種、75μLより4種の細胞が定量可能
- 免疫モニタリングの測定法として確立されており、多くの製薬企業が利用している。既に100以上の臨床試験から約68,000検体の測定実績
- 測定値は、フローサイトメトリーとの相関性が高い
- 異なる臨床試験からの検体でも有意義な比較が可能
- 特異性が高く、目的細胞のセルカウント情報も得られる。
- ISO 17025認定施設にてICH-GCP適合の測定試験
Epiontis IDの測定値は、フローサイトメトリーとの相関性が高いです。詳細については、次の論文をご参照ください：Epigenetic immune cell counting in human blood samples for immunodiagnostics. Baron et al. Sci Transl Med. 2018 Aug 1;10(452).
Epiontis IDアッセイ一覧
| Tリンパ球 | その他の免疫細胞 | 疲労・活性化・遊走マーカー | その他の細胞種 |
| CD3 T cells | B cells | PD1+ cells | Col1A1+ cells |
| CD4 T cells | Natural killer (NK) cells | TIGIT+ cells | PDGFRB+ cells |
| CD8 T cells | Neutrophils | CTLA4+ cells | |
| Regulatory T cells | Eosinophils | LAG3+ cells | |
| TH17 cells | Basophils | CXCR3+ cells | |
| TFH cells | Monocytes | Granulysin+ cells | |
| Gamma Delta (γδ) T cells | Non-classical (NC) monocytes | CCR7+ cells | |
| GATA3 positive cells | Monocytic MDSC | IL6R+ cells | |
| CD4 memory T cells | Plasmacytoid DC | CCR6+ cells | |
| CD8 naive T cells | Naive B cells | CRTH2+ cells | |
| Memory B cells | S1PR1+ cells | ||
| IgM positive B cells | S1PR5+ cells | ||
| Integrin alpha 4+ cells |
※ 上記はヒトのアッセイ系です。サル等の動物にも適応できる場合があります。また、アッセイのカスタム開発も可能ですのでご相談ください。
| 測定可能な検体 | |
| 血液関係 | 組織 |
| 全血 | 新鮮な組織 |
| PBMC | 凍結組織 |
| その他の単離細胞 | パラフィン包埋（FFPE）組織 |
| 乾燥血液スポット（DBS） | 鼻腔/口腔咽頭スワブ検体 |
| 血清作製時からの血餅 | RNAlaterで保存した組織 |
| 検体量と定量可能な細胞種類数 | ||
| 検体種類 | 量（例） | 細胞種類数 |
| 全血 | 300μL | 16 |
| 全血 | 75μL | 4 |
| 新鮮/凍結組織 | 1mg | 4 |
| PBMC | 0.5 x 106個 | 4 |
| FFPE切片 | 1枚 | 4 |
検体の処理と保管
血液検体の処理は、-20°Cで凍結するだけです。エピジェネティック・マーカーの安定性は高いため、基本的には-20°Cで保管された検体は、Epiontis ID技術による解析期限がありません。全血は、どの抗凝血剤でも使用可能です。
技術概要
Epiontis ID技術は、目的細胞特有の脱メチル化されたDNA配列をマーカーとしています。以下の図のように目的以外の細胞においては、同じ配列がメチル化されている状態となっています。まずは、検体からDNAを抽出しバイサルファイト変換（Bisulfite Conversion、略：「BiS変換」）をかけます。目的細胞のDNAは、マーカー領域の脱メチル化シトシン（C）はウラシル（U）に変換されますが、目的以外の細胞では、メチル化シトシンはそのまま残ります。シトシンがウラシルに変換された配列に結合するプライマーを利用してqPCRで目標細胞を定量します。Epiontis ID技術の開発元はPrecision for Medicine GmbH社（ドイツ）です。
EpiontisIDの紹介動画（英語）
文献
| 関係論文（一部掲載） | ||
| 発表年 | 詳細 | |
| 2020 | Epigenetically quantified immune cells in salivary glands of Sjögren’s syndrome patients: a novel tool that detects robust correlations of T follicular helper cells with immunopathology. Blokland et al. Rheumatology (Oxford). 2020;59(2):335-343 | 閲覧 |
| 2020 | Treatment with rapamycin can restore regulatory T-cell function in IPEX patients. Passerini et al. J Allergy Clin Immunol. 2020 Apr; 145(4):1262-1271 | 閲覧 |
| 2020 | Circulating immune cell composition and cancer risk: a prospective study using epigenetic cell count measures. Le Cornet et al. Cancer Res. 2020;80(9):1885-1892 | 閲覧 |
| 2019 | Human LAP+GARP+FOXP3+ regulatory T cells attenuate xenogeneic graft versus host disease. Wang et al. Theranostics. 2019;9(8):2315-2324 | 閲覧 |
| 2019 | Quantifying circulating Th17 cells by qPCR: potential as diagnostic biomarker for rheumatoid arthritis. Burska et al. Rheumatology (Oxford). 2019;58(11):2015-2024 | 閲覧 |
| 2018 | Epigenetic immune cell counting in human blood samples for immunodiagnostics. Baron et al. Sci Transl Med. 2018 Aug 1;10(452) | 閲覧 |
| クライアントによるポスター | ||
| 発表年 | タイトル | |
| 2019 | Celgene/BMS (Phase 1 study for Ozanimod): Use of Epigenetic Cell Counting to Determine the Effect of Ozanimod on Circulating Leukocyte Subtypes in Patients With Relapsing Multiple Sclerosis. | 依頼 |
| 2019 | Eli Lilly (Phase 2 study for Mirikizumab): Effects on CD3, Treg, and TH17 Cell Numbers in Skin Biopsies After 16-Week Mirkizumab Treatment, Evaluated by an Epigenetic Assay. | 依頼 |
| 2019 | Nektar Therapeutics/Oncomed (Parallel use of flow cytometry and Epiontis ID in oncology): Interim Biomarker Analysis of Etigilimab (OMP-313M32), an Anti-TIGIT Antibody, in Advanced Solid Tumors Supports TIGIT-associated Mechanisms of Action. | 依頼 |
| 2019 | Nektar Therapeutics/Oncomed (Parallel use of flow cytometry and Epiontis ID in oncology): Selective Induction of Activated Regulatory T-Cells in Healthy Volunteers by NKTR-358, a Novel IL-2 Conjugate Treg Stimulator, in Development for the Treatment of Autoimmune Diseases. | 依頼 |
| その他の書類 | |
| タイトル | |
| To Flow or Not to Flow: Immune Cell Profiling in Translational Research（ホワイトペパー） | 閲覧 |
| Next Generation Immune Monitoring: Epiontis ID（カタログ） | 閲覧 |